АНАЛИЗ СТРУКТУРНЫХ И ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИХ ПАРАМЕТРОВ ВОДОРОДНОЙ СВЯЗИ В КОМПЛЕМЕНТАРНЫХ ПАРАХ ОСНОВАНИЙ ДНК И РНК
Методами функционалов плотности B3LYP и M062X, WB97XD, B97D, оптимизированных для расчета дальних взаимодействий, проведен теоретический анализ структурных и термодинамических параметров водородосвязанных комплементарных пар оснований аденин–тимин, аденин–урацил и гуанин–цитозин. Вычисленные значения структурных и термодинамических параметров скорректированы на величину базисной суперпозиционной ошибки. Показано значительное преобладание энтальпийного фактора над энтропийным при образовании комплекса гуанин–цитозин, что обуславливает большое значения константы равновесия. Обсуждается применимость функционалов M062X, WB97XD, B97D для описания систем с водородной связью.
The methods of functional density B3LYP and M062X, WB97XD, WB97XD, B97D, optimized for the calculation of long-range interactions, theoretical analysis of the structural and thermodynamic parameters hydrogen-bonded complementary base pairs of adenine-thymine, adenine–uracil and guanine–cytosine has been carried out. Calculated numbers of the structural and thermodynamic parameters are adjusted by the amount of basic superposition error. Considerable predominance of the enthalpy factor upon the entropy one, during formation of the guanine–cytosine complex, causes great importance of the equilibrium constant. The applicability of functional M062X, WB97XD, B97D is being discussed for the description of hydrogen bond systems.